Praktikum Růst a vývoj rostlin MB130C78 pro odborné kombinace

Vyučující: Petrášek, Jan a kolektiv - RNDr. Lenka Havelková, Ph.D., Mgr. Alena Náprstková, Mgr. Jan Martinek,  Mgr. Pavel Jelínek, Mgr. Barbora Jelínková, Mgr. Anna Kampová, Mgr. Maria Voloshina

Rozsah 0/2 odpovídá celkově 24 h praktik, které jsou realizovány formou 4 šestihodinových bloků v průběhu zimního semestru. Vezměte si s sebou přezůvky a laboratorní plášť.

Termín a místo konání praktik pro podzimní semestr 2023/2024:

Místo konání je fyziologické praktikum B10, 2. patro Viničná 5, přímo proti schodům, vždy 9:00-15:00.

Paralelka I - Blok 1: po 23.10., Blok 2: po 6.11., Blok 3: po 20.11., Blok 4: po 4.12.

Paralelka II - Blok 1: pá 27.10., Blok 2: pá 10.11., Blok 3: pá 24.11., Blok 4: pá 8.12.

Paralelka III - Blok 1: po 30.10., Blok 2: po 13.11., Blok 3: po 27.11., Blok 4: po 11.12.

Zde je link na sdílenou tabulku pro zapisování do paralelek. Lze si vybrat vždy jeden termín u daného bloku.

Obsah bloků:
Praktické úlohy demonstrují vybrané kapitoly z vývoje rostlin, na kterých si budete moci konkrétně osahat experimentální materiál (zejména rostliny Arabidopsis thalina a Nicotiana tabacum) a současně poznat některé moderní metody jeho studia. Dokumentovat si budeme klíčení a růst rostlin, jeho regulaci hormonálními faktory, morfogenezi buněk v pletivech, reakci rostlin na podněty z okolí, vývoj samčího a samičího gametofytu, rozmnožování rostlin a vývoj embrya.

Blok 1: Hormonální regulace vývoje rostlin - Jan Petrášek, Pavel Jelínek, Lenka Havelková

úvodní prezentace, popis úloh

23.10 2023 Paralelka 1, 27.10. 2023 Paralelka 2, 30.10. 2023 Paralelka 3

Pro otvírání nasnímaných obrázků je často nutné využít programy, které umí nastavit LUTs tak abych si pěkně zobrazily i třeba velmi slabé signály, které se nám podařilo nasnímat. Doporučit lze tyto:

1) NIS element viewer

NIS-Elements Viewer | NIS-Elements | Software | Microscope Products | Nikon Instruments Inc.

U tohoto programu využijete funkci LUT adjusting, pracovat v tomto programu můžete s jakýmkoliv souborem typu tif či jpeg, apod.

Zde manuál NIS-Elements Viewer (d33b8x22mym97j.cloudfront.net). Doporučuji to provést tak, že si obrázek na obrazovce upravíte tak, aby byl jasně viditelný objekt a nebyl šum na pozadí a pak ho přes clipboard přenesete do protokolu.

2) ImageJ či Fiji - zde nejtypičtěji upravte obrázek pomocí vymezení horní a dolní hranice v image/adjust/brightness and contrast, není to sice úplně přesně LUT adjust tool, ale poslouží dobře. Opět pak přes clipboard do Vašeho protokolu.

Download (imagej.net)

Fiji Downloads (imagej.net)

Blok 2: Morfogeneze buněk listové epidermis, analýza fenotypu - Jan Martinek, Barbora Jelínková, Maria Voloshina

úvodní prezentace, popis úloh

Blok 3: Vývoj samčího a samičího gametofytu - Alena Náprstková, Pavel Jelínek

úvodní prezentace, popis úloh

20.11 2023 Paralelka 1, 24.11. 2023 Paralelka 2, 27.11. 2023 Paralelka 3

Blok 4: Embryogeneze a dědičnost znaků - Jan Petrášek, Lenka Havelková, Anna Kampová, Maria Voloshina

úvodní prezentace, popis úloh

15.12. 2023 Paralelka 1, 8.12. 2023 Paralelka 2, 11.12. 2023 Paralelka 3

Výstupem z praktik jsou protokoly za každého jednotlivce, které budou vedle docházky též podkladem k udělení zápočtu.

V protokolu prosím vždy uveďte číslo pracovní skupiny popř. předložené experimentální varianty.
Dále by měl protokol obsahovat název úlohy, cíl, použitý materiál, postup (stručně), výsledky s obrazovou dokumentací (pokud je k dispozici) a závěr (s možnou interpretací výsledků). Snažte se o věcnost a tvůrčí přístup k zadanému experimentu.

Protokoly ukládejte na sdílený disk, nejlépe ve formátu Google Docs či dokumentu Wordu. Ve sdíleném adresáři si prosím vytvořte svůj vlastní folder nadepsaný Vaším jménem a příjmením, do něj uložte soubory. Protokoly budeme hodnotit průběžně, ale zápočet budu udělovat během zkouškového období.

Zde je přehled stavu kontroly protokolů ve sdílené tabulce.