Praktikum Růst a vývoj rostlin MB130C78 pro odborné kombinace

Vyučující: Petrášek, Jan a kolektiv - RNDr. Lenka Havelková, Ph.D., Mgr. Jan Martinek,  Mgr. Pavel Jelínek, Mgr. Barbora Jelínková, Mgr. Anna Kampová, Mgr. Monika Kubalová, Mgr. Karel Raabe, Mgr. Maria Voloshina

Zde je link na sdílenou tabulku pro zapisování do paralelek. Prosím zapisujte se dle libosti, v každé paralelce je maximálně 12 míst.

Rozsah 0/2 odpovídá celkově 24 h praktik, které jsou realizovány formou 4 šestihodinových bloků v průběhu zimního semestru. Vezměte si s sebou přezůvky a laboratorní plášť.

Místo konání je fyziologické praktikum B10, 2. patro Viničná 5, přímo proti schodům, vždy 9:00-15:00.

Termín a místo konání praktik pro podzimní semestr 2024/2025:

Paralelka I - Blok 1: pá 25.10., Blok 2: pá 8.11., Blok 3: pá 22.11., Blok 4: po 2.12.

Paralelka II - Blok 1: pá 1.11., Blok 2: pá 15.11., Blok 3: po 25.11., Blok 4: pá 6.12.

Paralelka III - Blok 1: po 4.11., Blok 2: po 18.11., Blok 3: pá 29.11., Blok 4: po 9.12.

Obsah bloků:
Praktické úlohy demonstrují vybrané kapitoly z vývoje rostlin, na kterých si budete moci konkrétně osahat experimentální materiál (zejména rostliny Arabidopsis thalina a Nicotiana tabacum) a současně poznat některé moderní metody jeho studia. Dokumentovat si budeme klíčení a růst rostlin, jeho regulaci hormonálními faktory, morfogenezi buněk v pletivech, reakci rostlin na podněty z okolí, vývoj samčího a samičího gametofytu, rozmnožování rostlin a vývoj embrya.

Blok 1: Hormonální regulace vývoje rostlin - Jan Petrášek, Pavel Jelínek, Lenka Havelková

úvodní prezentace, popis úloh

25.10 2024 Paralelka 1, 1.11.2024 Paralelka 2, 4.11.2024 Paralelka 3

Pro otvírání nasnímaných obrázků je často nutné využít programy, které umí nastavit LUTs tak abych si pěkně zobrazily i třeba velmi slabé signály, které se nám podařilo nasnímat. Doporučit lze tyto:

1) NIS element viewer

NIS-Elements Viewer | NIS-Elements | Software | Microscope Products | Nikon Instruments Inc.

U tohoto programu využijete funkci LUT adjusting, pracovat v tomto programu můžete s jakýmkoliv souborem typu tif či jpeg, apod.

Zde manuál NIS-Elements Viewer (d33b8x22mym97j.cloudfront.net). Doporučuji to provést tak, že si obrázek na obrazovce upravíte tak, aby byl jasně viditelný objekt a nebyl šum na pozadí a pak ho přes clipboard přenesete do protokolu.

2) ImageJ či Fiji - zde nejtypičtěji upravte obrázek pomocí vymezení horní a dolní hranice v image/adjust/brightness and contrast, není to sice úplně přesně LUT adjust tool, ale poslouží dobře. Opět pak přes clipboard do Vašeho protokolu.

Download (imagej.net)

Fiji Downloads (imagej.net)

Blok 2: Morfogeneze buněk listové epidermis, analýza fenotypu - Jan Martinek, Barbora Jelínková, Maria Voloshina

úvodní prezentace, popis úloh

Blok 3: Vývoj samčího a samičího gametofytu - Karel Raabe, Monika Kubalová, Pavel Jelínek

úvodní prezentace, popis úloh

22.11. 2024 Paralelka 1, 25.11. 2024 Paralelka 2, 29.11. 2024 Paralelka 3

Blok 4: Embryogeneze a dědičnost znaků - Jan Petrášek, Lenka Havelková, Anna Kampová, Maria Voloshina

úvodní prezentace, popis úloh

2.12. 2024 Paralelka 1, 2.12. 2024 Paralelka 2, 9.12. 2024 Paralelka 3

Výstupem z praktik jsou protokoly za každého jednotlivce, které budou vedle docházky též podkladem k udělení zápočtu.

V protokolu prosím vždy uveďte číslo pracovní skupiny popř. předložené experimentální varianty.
Dále by měl protokol obsahovat název úlohy, cíl, použitý materiál, postup (stručně), výsledky s obrazovou dokumentací (pokud je k dispozici) a závěr (s možnou interpretací výsledků). Snažte se o věcnost a tvůrčí přístup k zadanému experimentu.

Protokoly ukládejte na sdílený disk, nejlépe ve formátu Google Docs či dokumentu Wordu. Ve sdíleném adresáři si prosím vytvořte svůj vlastní folder nadepsaný Vaším jménem a příjmením, do něj uložte soubory. Protokoly budeme hodnotit průběžně, ale zápočet budu udělovat během zkouškového období.

Zde je přehled stavu kontroly protokolů ve sdílené tabulce.